我国科研团队率先完成菊花基因组测序

引言：12月7日，中国中医科学院中药研究所和安利植物研发中心宣布，由该联合团队发起的菊花全基因组计划取得重大进展，利用纳米孔测序技术突破复杂基因组测序，该团队在世界首次完成了菊属植物菊花的全基因组测序，并完成了重要的药用菊花品种——杭白菊的全长转录组遗传信息发掘。相关研究成果和基因组数据已于12月7日在中国中医科学院中药研究所官网及安利植物研发中心学术研究网站公布，并向全世界研究菊花的学术团队和非盈利组织免费开放。

菊属植物染色体结构复杂，包含从2n=18到8n=72之间的各种染色体组结构。生产上作为菊花茶使用的菊花（以著名的杭白菊为例）是一个复杂的多倍体物种，有多套二倍体亚基组成。菊属是一个非常大的植物分类单位，包括菊组和苞叶组两大分支。被广泛熟知的野菊花、甘菊、菊花、异色菊等都属于菊组，该分支植物主要特点为全部总苞片草质，边缘白色、褐色、棕褐色或黑褐色膜质,而在每一个物种之下又有数量不等的栽培种，例如菊花展上的数以千计的观赏菊花和著名的五大药用菊花都同属于一个品种——菊花。面对菊花的复杂染色体遗传结构以及丰富的种质资源多样性，进行菊花基因组测序对于揭示菊属物种的起源进化及物种多样性具有重要意义。

中国中医科学院中药研究所与安利植物研发中心为此联合发起了菊花基因组研究攻关，利用纳米孔测序结合二代高通量测序技术对分布于江苏南京的野菊花品种进行的全基因测序、组装、注释及相关分析,共组装出了约3Gb基因组总长，鉴定出了101745个编码蛋白基因，通过比较研究发现，整个基因组中存在大量的重复序列，这可能是整个菊属植物基因组较为复杂的原因，同时对多倍体菊花品种杭白菊进行起了全长转录组比较分析，阐明野菊花和杭白菊直接存在极大的遗传上的亲缘关系。目前研究团队还在对相关研究结果开展进一步的深入研究分析。

菊花基因组测序的完成，不仅对菊属的物种多样性研究、菊花的遗传进化机制研究和分子遗传育种等研究工作具有重要的意义，而且对研究具有重要药用价值的多倍体药用菊花——杭白菊具有重大的参考价值。必将极大推动植物基因组、尤其是药用植物基因组研究的发展，是本草基因组学研究的一项重要突破。